Jedną z nowych funkcji Nintendo Switch 2 jest tryb myszy Joy-Con 2. Jeśli Joy-Con 2 jest obsługiwany jak mysz i przesuwany po stole lub podobnej powierzchni, automatycznie działa bardzo podobnie do myszy. Działa to jednak tylko w grach, które obsługują ten tryb.
Obejmuje to kilka hitów w momencie premiery, takich jak Cyberpunk 2077, Hogwarts Legacy, Metroid Prime 4: Beyond, Puyo Puyo Tetris 2S i Civilization VII. Jak się jednak okazuje, możliwe jest również podłączenie myszy USB do Nintendo Switch 2 zamiast używania Joy-Cona jako myszy. Koei Tecmo używa Nobunaga's Ambition: Awakening jako przykładu demonstrującego działanie myszy USB w praktyce
Po podłączeniu myszy w lewym górnym rogu ekranu pojawi się powiadomienie potwierdzające, że mysz została rozpoznana. Następnie można jej używać bezpośrednio w grze. Gdy tylko mysz zostanie poruszona, pojawia się ikoniczny kursor myszy, który ułatwia wybieranie elementów. Gdy używany jest Joy-Con, kursor przekształca się z powrotem w narzędzie wyboru zoptymalizowane pod kątem kontrolera.
Korzystanie z Joy-Cona w lewej ręce i myszy w prawej ręce w celu wygodniejszego sterowania grami jest również możliwe. Nie jest jasne, czy Nintendo zaoferuje tryb dla leworęcznych w całym systemie, ale możliwe jest przynajmniej aktywowanie trybu dla leworęcznych w ustawieniach gry i dostosowanie czułości myszy. Szczegóły dotyczące obsługiwanych modeli myszy wciąż nie są znane, na przykład czy można używać myszy bezprzewodowej z kluczem USB.