Sztuczna inteligencja modyfikuje geny drobnoustrojów w celu produkcji paliw odnawialnych

Od ponad pół dekady Centrum Innowacji Bioenergetycznych (CBI) majstruje przy genach roślin i drobnoustrojów, aby sprostać ostatecznemu wyzwaniu, jakim jest zrównoważona gospodarka oparta na biologii.

CBI wykorzystuje superkomputery, algorytmy głębokiego uczenia i narzędzia do edycji genów, takie jak CRISPR Cas9, aby połączyć genotyp z fenotypem. Jednak ich badania były nękane przez niekompatybilność istniejących modeli łączenia genów z genomami drobnoustrojów.

Aby usprawnić projektowanie maszyn CRISPR Cas9, naukowcy z Oak Ridge National Library (ORNL) zbudowali wytłumaczalny model sztucznej inteligencji i wytrenowali go w celu zidentyfikowania wskazówek molekularnych, które umożliwiają celowanie w określone regiony genomu drobnoustrojów. Nowy model, zwany iteracyjnym lasem losowym https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkad736/7279034wykazano już, że optymalizuje rozszczepianie i wiązanie DNA w bakteriach E. Coli.